皖南医学院现有新、老两个校区，占地700余亩，各类建筑35万平方米。本科教育设有临床医学、法医学、口腔医学、麻醉学、影像医学、药学等21个专业，护理、药学等9个专科专业，涉及医、理、工、管、经、法6个学科门类；现有生物学、基础医学、临床医学等3个硕士一级学科授权点，包括生理学、神经生物学、病原生物学、病理学与病理生理学、法医学、内科学、神经病学、影像医学与核医学、外科学、妇产科学、肿瘤学、麻醉学、中西医结合基础、药理学及应用心理学等31个二级学科，基本涵盖了基础医学及临床医学各学科。
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